玉米基因組數據集

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和水稻和小麥一樣,玉米是一種非常重要的農作物。在美國,它是最重要的經濟作物。除了用作谷物和飼料外,它還廣泛應用于制藥生產,以及作為其他有機化工產品如橡膠、乙醇和塑料的原料。除了經濟上的重要性之外,幾十年來它已經成為一個經典的植物遺傳研究模型。玉米核基因組是雙二倍體——兩個二倍體基因組的融合(Helentjaris T, Weber D, Wright S. 1988)或異源多倍體(Wilson WA et al. 1999)具有旋鈕異染色質。旋鈕異染色質是185 bp元件(Peacock WJ et al. 1981)和350 bp元件(Ananiev EV et al. 1998)的重復。在不同的玉米品種之間,大量的復制信息在3至4個數量級之間變化。這導致了玉米之間的基因組大小范圍廣泛。最小的估計為2400 Mbp,具有高比例的重復DNA。當代美國玉米作物是將各種性狀滲入一組玉米品種的結果。族譜顯示,每種玉米的兩個不同的組合是:北方燧石和南方凹痕[(Allard RW. 1999); (Doebley et al. Econ Bot 1988 42:120-131)]。玉米基因組亞種(玉米)核苷酸序列的第一份草案于2007年2月28日在第五十屆玉米遺傳會議上予以公布。

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